Genòmica computacional
Asignatura del Grau en Bioinformàtica
Información académica
Codi:
53129
Créditos:
5 ECTS
Idioma:
Anglès
Tipus d'assignatura: Obligatòria
Descripció
En la genòmica computacional es duen a terme anàlisis computacionals per entendre la biologia de les seqüències dels genomes en estudi (ADN, ARN, dades de microarrays...). Amb un enfocament eminentment genòmic, l’objectiu és aplicar mètodes computacionals per entendre l’estructura i la funció de les seqüències. Es posarà un èmfasi especial en el procés d’anotació dels elements funcionals a nivell genòmic.
Assignatura que pertany al Grau en Bioinformàtica, si ho desitjes pots consultar l'informació completa del curs.
Josep Francesc Abril
Professor
Genòmica computacional
Doctor en Ciències de la Salut i de la Vida (UPF)
Llicenciat en Biologia, especialitat Fonamental (UB)
La seva tasca de recerca se centra en l’anàlisi computacional de seqüències per a la realització i anotació projectes òmics, des de l’assemblatge fins a la descripció funcional de gens i genomes, passant per la integració en xarxes d’interacció, el modelatge de senyals eucariòtrics i estructures gèniques, la visualització de trets genòmics (com en el cas del mapa del genoma humà de l’article publicat a Science l’any 2001), la descripció de comunitats víriques a partir de mostres metagenòmiques, etc. Els seus organismes preferits són les planàries, les mosques i els éssers humans, i no necessàriament en aquest ordre. Ha participat en projectes per avaluar la fiabilitat dels programes de predicció de gens, com ara el GASP en la mosca i l’EGASP/RGASP en humans.
Cinta Pegueroles
Professora
Doctora en Genètica (UB)
Maria Cinta Pegueroles és graduada en Biologia (2006) i doctora en Genètica (2010) per la Universitat de Barcelona (UB). Ha treballat com a investigadora postdoctoral a la Fundació Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (FIMIM), al Parc Científic de Barcelona (PCB), al Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR) i al Centre de Regulació Genòmica (CRG), i com a enginyera de recerca al Barcelona Supercomputing Center (BSC). Actualment és professora associada a la Universitat de Barcelona i professora col·laboradora en la Universitat Oberta de Catalunya.
Biòloga especialitzada en genètica i bioinformàtica, els seus principals interessos en el camp de la recerca són la genòmica, l’evolució i l’adaptació de poblacions. El seu objectiu general és entendre com evolucionen els genomes utilitzant dades a gran escala; en particular, està interessada a entendre les bases genètiques de l’adaptació i desxifrar la funcionalitat dels gens llargs no codificants, així com el seu paper en l’evolució i adaptació del genoma. Per fer-ho, utilitza tant una perspectiva evolutiva que proporciona informació d’esdeveniments antics com una perspectiva poblacional que aporta dades sobre esdeveniments més recents.